菌株分型技术基于微生物DNA指纹图谱分析和基因组DNA序列分析，是工业企业快速、准确、高分辨开展微生物菌株株水平鉴定、分子分型和溯源调查的有力工具。近来年，随着各行业法规指南的不断趋于完善，越来越多行业将产品申报、政府监管等过程中对微生物的要求体现在菌株水平，实现同种不同菌株的区分对于各行业的发展起着越来越重要的作用。CICC建立了国际领先的微生物菌株分型技术平台，包括核糖体分型（Ribotyping）、脉冲场凝胶电泳（PFGE）、随机扩增DNA多态性（RAPD）、多基因序列位点分析（MLST）和全基因组测序（WGS）等，为微生物溯源和菌株分型技术难题提供解决方案PFGE、RAPD、MLST等。

图5-1 山西老陈醋醋醅中分离的醋酸菌菌株的碳源利用特性及ERIC/PCR菌株分型

图5-2 山西老陈醋中芽孢杆菌的RAPD的基因分型结果

图5-3 传统发酵食品中乳酸菌的PAPD分型电泳图